Elke regio heeft een onafhankelijk syntra-netwerk (syntra Antwerpen/Vlaams-Brabant; syntra Brussel; syntra Limburg, syntra Midden-Vlaanderen en syntra West).
Hoewel er afstemming is tussen de syntra welke opleidingen er worden aangeboden, welke modules aan bod moeten komen en wat de eindcriteria zijn, staat het elke organisatie vrij om te kiezen welke specifieke opleidingen ze in hun aanbod willen opnemen. Ook de administratie en facturatiedienst werken onafhankelijk van elkaar.
Dit kan zich vertalen in een ander opleidingsaanbod, alsook andere inschrijvingsvoorwaarden en prijzen die de syntra hanteren.